评估MES系统是否适合公司的生产流程时，需要特别关注以下关键性能指标：

1. 数据采集与传输性能：关注数据采集的速度、准确性和稳定性，确保生产数据的即时性和无误传输 。
2. 生产计划与调度性能：考察计划编制的灵活性、调度的准确性和响应速度，以适应不同的生产需求和变化 。
3. 质量管理性能：评估质量数据的实时采集和分析能力、异常检测和预警机制以及质量追溯和报告生成功能 。
4. 设备管理性能：考虑设备状态监控、设备维护管理和设备故障诊断等方面，确保设备高效运行 。
5. 物料管理性能：分析物料追踪与管理能力、物料库存控制以及供应链管理效率 。
6. 报表与分析性能：检查报表生成的速度和准确性，以及数据分析的灵活性和深度挖掘能力 。
7. 系统响应时间：系统从接收到请求到做出响应的时间，直接影响生产效率 。
8. 数据准确性：确保系统准确地采集、处理和传输数据，对生产决策至关重要 。
9. 系统可用性：系统在一定时间段内可用的百分比，高可用性意味着系统稳定性强 。
10. 资源利用率：包括CPU使用率、内存占用率等，合理管理可以提升系统性能和稳定性 。
11. 容量规划：确保系统在业务增长中依然能够高效运行 。
12. 安全性和灾备恢复：系统数据安全、访问权限控制，以及有效的灾备方案 。

通过这些性能指标的评估，企业可以确保MES系统不仅满足当前的生产需求，而且具备未来业务扩展和变更的适应能力。